Spelet är utvecklat i ett hemligt laboratorium som ligger på botten av havet. Här i ensamhet bodde en excentrisk vetenskapsman, erfarenheter och experiment kollegor klandra honom. Hans huvuduppgift var att skapa en levande varelse utrustade med förnuft och år senare gjorde han det. Men samtidigt skaparen försvann under mystiska omständigheter, lämnar Goo (detta namn har fått sin avkomma) och vänta på honom att missa. Hjälte trött på att hänga ut i en kolv-kamera och få ut av det, gick han på en rundtur i komplexet att hitta spår av de saknade vän. Möjligheten att välja graden av elasticitet kommer att bidra till att övervinna olika hinder, för att klara av fienden och att tränga in till där den vanliga människan eller hur man inte att få.